Laboratorium Keunggulan FK Hamzanwadi adalah laboratorium yang dikhususkan untuk proses pembelajaran yang menunjang keunggulan FK Hamzanwadi yaitu: “Menghasilkan Dokter yang Unggul pada Penanganan Penyakit ISPA Bagian Atas”. Laboratorium Keunggulan FK Hamzanwadi di-setting dengan menggunakan model laboratorium klinis dengan dibagi menjadi dua area yaitu area Promotif-Preventif dan area Kuratif-Rehabilitatif.